RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GPR137Q96N19 417 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MED20Q9H944 212 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MED17Q9NVC6 651 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HPF1Q9NWY4 346 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC5O15389 551 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TXNL1O43396 289 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV1-44P01699 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 APRTP07741 180 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 LYNP07948 512 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TPBGLP0DKB5 382 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF4P43489 277 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RABIFP47224 123 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NUMBP49757 651 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 INAQ16352 499 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf189Q5VU69 101 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CACUL1Q86Y37 369 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR4L1Q8NH43 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GPR148Q8TDV2 347 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 USP28Q96RU2 1077 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FGF22Q9HCT0 170 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 KLK11Q9UBX7 282 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL1O95841 491 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC12O95881 172 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 KRT5P13647 590 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OPRL1P41146 370 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CD86P42081 329 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A12P48065 614 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 BACE1P56817 501 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 EVCP57679 992 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GMFBP60983 142 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DHODHQ02127 395 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TRADDQ15628 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CES4AQ5XG92 561 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OLFM4Q6UX06 510 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ESAMQ96AP7 390 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RAB39BQ96DA2 213 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C14orf79Q96F83 325 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf58Q96LI9 332 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SYT15Q9BQS2 421 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 LRP12Q9Y561 859 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 UBE4BO95155 1302 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 OR6B1O95007 311 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 EDNRAP25101 427 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 MMP12P39900 470 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 FHITP49789 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CDKL1Q00532 357 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GCKRQ14397 625 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 MTF1Q14872 753 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RTL6Q6ICC9 239 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO2A1Q92959 643 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 COQ7Q99807 217 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PINK1Q9BXM7 581 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 WWP1Q9H0M0 922 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 B4GAT1O43505 415 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GPX3P22352 226 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PRKACGP22612 351 aa6.57□□□□□ -1.36
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