RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ADAMDEC1O15204 470 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SH3BGRLO75368 114 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRKAR1AP10644 381 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ANXA8P13928 327 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DDCP20711 480 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.351e-8■■■■□ 24.2
NISCH-212ENST00000488380 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CAV3P56539 151 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ERICH5Q6P6B1 374 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A5O76082 557 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TPPPO94811 219 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GJA1P17302 382 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CNR2P34972 360 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GANABQ14697 944 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CDKN3Q16667 212 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB37Q5TC79 503 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD54Q6NXT1 300 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PHC2Q8IXK0 858 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 STK40Q8N2I9 435 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SEC14L4Q9UDX3 406 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMCC3Q9ULS5 477 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 H3BUI4 141 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FABP7O15540 132 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRBC1P01850 177 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SCG5P05408 212 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 COX7A2P14406 83 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SDC1P18827 310 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ10P78508 379 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 IL18Q14116 193 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TIGD3Q6B0B8 471 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SYT12Q8IV01 421 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GPR26Q8NDV2 337 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HYLS1Q96M11 299 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CD244Q9BZW8 370 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NDUFAF4Q9P032 175 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RHCGQ9UBD6 479 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FZD4Q9ULV1 537 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ENTPD6O75354 484 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ALDH1A1P00352 501 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF30P17039 623 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ACRV1P26436 265 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CD70P32970 193 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SDC2P34741 201 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SOX9P48436 509 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MYLIPQ8WY64 445 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 APIPQ96GX9 242 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMEM245Q9H330 911 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF222Q9UK12 451 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 STUB1Q9UNE7 303 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 J3KTA2 159 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ORC5O43913 435 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CLDN9O95484 217 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ARSBP15848 533 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRYBB2P43320 205 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RGS4P49798 205 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 BCL2L1Q07817 233 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SNTA1Q13424 505 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GPRC6AQ5T6X5 926 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RBFAQ8N0V3 343 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RNF175Q8N4F7 328 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB2Q8N680 514 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CREB3L4Q8TEY5 395 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 VOPP1Q96AW1 172 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DOHHQ9BU89 302 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 OARD1Q9Y530 152 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms