RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	LDB3	O75112	727 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	IFNA16	P05015	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	CD1D	P15813	335 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	CHRNB4	P30926	498 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	KCNC1	P48547	511 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	ID2	Q02363	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	PMPCA	Q10713	525 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	CBLB	Q13191	982 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	GXYLT1	Q4G148	440 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	ASB5	Q8WWX0	329 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	RND1	Q92730	232 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	SCYL1	Q96KG9	808 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TAF6-215	ENST00000487288		A0A088AWK7	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	C17orf105	B2RV13	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CLGN	O14967	610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	STK16	O75716	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ETHE1	O95571	254 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CELA3A	P09093	270 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	MSX1	P28360	303 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SSTR1	P30872	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	RNF4	P78317	190 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	POU4F1	Q01851	419 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	FANCG	O15287	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	IGHG3	P01860	377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	C1QA	P02745	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CCL3	P10147	92 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CNR1	P21554	472 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	MAGEA5	P43359	124 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	DNASE1L1	P49184	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	FOXO1	Q12778	655 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	STX4	Q12846	297 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CHIT1	Q13231	466 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	E2F2	Q14209	437 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	5e-7	■■■■□ 26.2
TAF6-215	ENST00000487288	PDK4	Q16654	411 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF721	Q8TF20	911 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	NF1	P21359	2839 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288		A0A1B0GVC2	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ACOT7	O00154	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	TNNI3	P19429	210 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	MSH2	P43246	934 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TAF6-215	ENST00000487288	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21

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