RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	ADAM8	P78325	824 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	LIME1	Q9H400	295 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	KLK8	O60259	260 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CLEC3A	O75596	197 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	IVD	P26440	423 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ACVR2A	P27037	513 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	GSTM2	P28161	218 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MAGEA5	P43359	124 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	LIM2	P55344	173 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MYBPH	Q13203	477 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM198	Q66K66	360 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SERINC2	Q96SA4	455 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	OR14I1	A6ND48	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	BCKDK	O14874	412 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CTNS	O60931	367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	IGHG3	P01860	377 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CELA3A	P09093	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	GLI4	P10075	376 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CNR1	P21554	472 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MTTP	P55157	894 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MGAT5	Q09328	741 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TRIL	Q7L0X0	811 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CTSL-205	ENST00000482054	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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