RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 DPH7Q9BTV6 452 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AICDAQ9GZX7 198 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.32■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 DRD2P14416 443 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ITGA2P17301 1181 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TNFRSF1BP20333 461 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AHRP35869 848 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC32Q14392 662 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FBXL6Q8N531 539 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CD93Q9NPY3 652 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 THSD1Q9NS62 852 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CA5BQ9Y2D0 317 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SLC1A7O00341 560 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 PPM1DO15297 605 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HTR1BP28222 390 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFS1P28331 727 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 REEP3Q6NUK4 255 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM69Q86WT6 500 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SMRP1Q8NCR6 262 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KLHL31Q9H511 634 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 EXD2Q9NVH0 621 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.31■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 C5orf58C9J3I9 102 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 H0Y8X5 98 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TNFRSF11BO00300 401 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SH3BP5O60239 455 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 STATHP02808 62 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFV2P19404 249 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AGXTP21549 392 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ACSL1P33121 698 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 OR1E2P47887 323 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CDK5R2Q13319 367 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 LCN9Q8WX39 176 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 APOL4Q9BPW4 351 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 FANCEQ9HB96 536 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 A4GALTQ9NPC4 353 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 EHD3Q9NZN3 535 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RAB23Q9ULC3 237 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ISM1B1AKI9 464 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 APBB3O95704 486 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC159P0C7I6 412 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 HYAL2Q12891 473 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SLC9A5Q14940 896 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 MLC1Q15049 377 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TCEA2Q15560 299 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 EOGTQ5NDL2 527 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 MS4A6EQ96DS6 147 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 KCNC2Q96PR1 638 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SARGQ9BW04 601 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 EBF1Q9UH73 591 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SNX7Q9UNH6 387 aa16.3■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 EML2O95834 649 aa16.29■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TPMTP51580 245 aa16.29■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 SPIBQ01892 262 aa16.29■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.29■□□□□ 0.2
FAAP20-211ENST00000469733 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms