RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 G3V2T6 193 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 BTN3A3O00478 584 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MAN2B1O00754 1011 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PDPK1O15530 556 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PGM3O95394 542 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE6O95741 557 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CLIC3O95833 236 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CLPTM1O96005 669 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HTR1AP08908 422 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TFPTP0C1Z6 253 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 SRFP11831 508 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 F3P13726 295 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DRD2P14416 443 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 ACVR2AP27037 513 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 HLCSP50747 726 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 MAPK12P53778 367 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 CYP4F2P78329 520 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNAB2Q13303 367 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GAS6Q14393 721 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DS3Q14952 304 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 TEAD4Q15561 434 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZS52 159 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 UCN3Q969E3 161 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 DOHHQ9BU89 302 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.36□□□□□ -1.55
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