RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF750Q32MQ0 723 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TRILQ7L0X0 811 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM251Q8N6I4 163 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SCYL1Q96KG9 808 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 EHD1Q9H4M9 534 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 LIPGQ9Y5X9 500 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 PSAT1Q9Y617 370 aa24.43■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 CES2O00748 559 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 AQP7O14520 342 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 IVDP26440 423 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 CERS1P27544 350 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TAS2R39P59534 338 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 STX4Q12846 297 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SERTAD2Q14140 314 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 OR5L2Q8NGL0 311 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 ANKRD49Q8WVL7 239 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1191Q96A73 305 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 POPDC3Q9HBV1 291 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SACM1LQ9NTJ5 587 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 FAM215AQ9Y5M1 114 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SPG11Q96JI7 2443 aa24.42■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 G3V3Y1 287 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SUSD5O60279 629 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 GLI4P10075 376 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 MAGEA5P43359 124 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 RNF4P78317 190 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TGM3Q08188 693 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 MGAT5Q09328 741 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 OPN5Q6U736 354 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 VPS39Q96JC1 886 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 OR8D2Q9GZM6 311 aa24.41■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 EML6Q6ZMW3 1958 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 WDR1O75083 606 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TNNI3P19429 210 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 TGFBIQ15582 683 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 C7orf57Q8NEG2 295 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SLC2A12Q8TD20 617 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 NINJ1Q92982 152 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 SARAFQ96BY9 339 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 PWWP2AQ96N64 755 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 LYRM4Q9HD34 91 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 PRDM7Q9NQW5 492 aa24.4■■□□□ 1.5
PBRM1-218ENST00000458294 A0A0G2JNJ9 132 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FAM221AA4D161 298 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 C17orf105B2RV13 164 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CLGNO14967 610 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 P04436 131 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 GGT5P36269 586 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 KCNC1P48547 511 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 MAN2A2P49641 1150 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 IST1P53990 364 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FOLH1Q04609 750 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FOXO1Q12778 655 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 RTL6Q6ICC9 239 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 KCNC2Q96PR1 638 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FOXC2Q99958 501 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 Q9UFV3 132 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SNX12Q9UMY4 172 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 L3MBTL1Q9Y468 752 aa24.39■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC10A1Q14973 349 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 WLSQ5T9L3 541 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SLC35F6Q8N357 371 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NRGNQ92686 78 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 WDR34Q96EX3 536 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 POM121Q96HA1 1249 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 TMUB1Q9BVT8 246 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 DERL2Q9GZP9 239 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 CXXC4Q9H2H0 198 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 LDAHQ9H6V9 325 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 WWOXQ9NZC7 414 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 COPS7AQ9UBW8 275 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ACAD8Q9UKU7 415 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ATG4BQ9Y4P1 393 aa24.38■■□□□ 1.49
PBRM1-218ENST00000458294 ITPR3Q14573 2671 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms