RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 LDB3O75112 727 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK16O75716 305 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM155BO75949 473 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2J2O76002 312 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6B1O95007 311 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETHE1O95571 254 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTHFD2P13995 350 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX6B1P14854 86 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTGS2P35354 604 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMSP52788 366 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTTPP55157 894 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASP6P55212 293 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNG11P61952 73 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDH1Q08174 1060 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC13A2Q13183 592 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TESK1Q15569 626 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRADDQ15628 312 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYPD8Q6UX82 237 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ISCA2Q86U28 154 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAS2Q8IYD9 372 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTLQ8NG68 377 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2M7Q8NG81 312 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF721Q8TF20 911 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCT6BQ92526 530 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1191Q96A73 305 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPNE1Q99829 537 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERP44Q9BS26 406 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPH5Q9H2P9 285 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 WWOXQ9NZC7 414 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 WHRNQ9P202 907 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYOTQ9UBF9 498 aa7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS13CQ709C8 3753 aa7.84□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMX2A2RU54 273 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRKO00198 91 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 WWP2O00308 870 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRRG2O14669 202 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF17O60258 216 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFAND5O76080 213 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHG3P01860 377 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV3-11P04433 115 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPOP07202 933 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 STMN1P16949 149 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 GP5P40197 560 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASP2P42575 452 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSR4P51571 173 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB10P61026 200 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V0D1P61421 351 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF4P78317 190 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ID2Q02363 134 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXO1Q12778 655 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHIT1Q13231 466 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBCCQ15814 346 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDK4Q16654 411 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTL6Q6ICC9 239 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYS1Q717R9 158 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPSM1Q86YR5 675 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT78Q8N1N4 520 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM156Q8N614 296 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf79Q96F83 325 aa7.83□□□□□ -1.16
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAR2Q96K12 515 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms