RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HSPB2A8KAH6 182 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CLDN4O14493 209 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 INHBBP09529 407 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SOX3P41225 446 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MAGEA3P43357 314 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MAGEA5P43359 124 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RGS4P49798 205 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RAB8AP61006 207 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 REEP5Q00765 189 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RUNX2Q13950 521 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CSHL1Q14406 222 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HSPB2Q16082 182 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 WLSQ5T9L3 541 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RTL4Q6ZR62 310 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PALM2Q8IXS6 379 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MORN4Q8NDC4 146 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MCUQ8NE86 351 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CALML6Q8TD86 181 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ATL1Q8WXF7 558 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 NEIL2Q969S2 332 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PYCR2Q96C36 320 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FBXL8Q96CD0 374 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SCYL1Q96KG9 808 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 KRT12Q99456 494 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SMR3AQ99954 134 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PELI2Q9HAT8 420 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZANQ9Y493 2812 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FAM187AA6NFU0 413 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CYR61O00622 381 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SERPIND1P05546 499 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HEXAP06865 529 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CELA3AP09093 270 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 EPXP11678 715 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HIST1H2ADP20671 130 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GABRB3P28472 473 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PPP2R1BP30154 601 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TIMP3P35625 211 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 KCNJ1P48048 391 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MAN2A2P49641 1150 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ASCL1P50553 236 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HK2P52789 917 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GUCY2DQ02846 1103 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CASC4Q6P4E1 433 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HSDL2Q6YN16 418 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SLCO2A1Q92959 643 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms