RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHF11Q9UIL8 331 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX6Q9UNH7 406 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.64□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A0G2JN53 185 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DYTNA2CJ06 578 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM227AF5H4B4 570 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COPEO14579 308 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SUPT7LO94864 414 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT6AP02538 564 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT6BP04259 564 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP2R1BP30154 601 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SSR2P43308 183 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLCO1A2P46721 670 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT6CP48668 564 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PKNOX1P55347 436 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAS2R50P59544 299 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJB13P59910 316 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTG2P78543 158 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLE1Q04724 770 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAF3Q13114 568 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC13A2Q13183 592 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAPSNQ13702 412 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SERTAD2Q14140 314 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLR1Q15399 786 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MEP1AQ16819 746 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BTBD16Q32M84 506 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UNC50Q53HI1 259 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC6A19Q695T7 634 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CROCCP2Q86T23 111 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TANKQ92844 425 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF382Q96SR6 550 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRF2Q9HAW0 419 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNK13Q9HB14 408 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MKS1Q9NXB0 559 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KALRNO60229 2985 aa7.63□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLDC2A0PJX2 215 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SERTM1A2A2V5 107 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2W5A6NFC9 320 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MASP2O00187 686 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLPP1O14494 284 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLIN3O60664 434 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GUCY1B2O75343 617 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WISP1O95388 367 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PROCP04070 461 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYL2P10916 166 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ITGAMP11215 1152 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD3B1P14060 373 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT4P19013 534 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD3B2P26439 372 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CERS1P27544 350 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD97P48960 835 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDH13P55290 713 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC26A5P58743 744 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASPHQ12797 758 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STX4Q12846 297 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LCP2Q13094 533 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLAMF1Q13291 335 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NADK2Q4G0N4 442 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.62□□□□□ -1.19
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms