RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 EURLQ9NYK6 297 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 IL17CQ9P0M4 197 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ABI3Q9P2A4 366 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SNX24Q9Y343 169 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP73A6NFT4 308 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF487B1APH4 448 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 E7EVH7 732 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A6O15403 523 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CDH16O75309 829 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PIGNO95427 931 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 EML2O95834 649 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 JCHAINP01591 159 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV3-25P01717 112 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 F3P13726 295 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 BRAFP15056 766 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2A7P20853 494 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MST1P26927 711 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 GPR1P46091 355 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MAP2K6P52564 334 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CDK3Q00526 305 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PYCR3Q53H96 274 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 LCN10Q6JVE6 187 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL35Q6PF15 583 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PAQR7Q86WK9 346 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 KMT5CQ86Y97 462 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB106AQ8N104 65 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PRR18Q8N4B5 295 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 NRACQ8N912 160 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF606Q8WXB4 792 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PTERQ96BW5 349 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 C18orf8Q96DM3 657 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TAAR6Q96RI8 345 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZYG11BQ9C0D3 744 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 LHPPQ9H008 270 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TKTL2Q9H0I9 626 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 UCK1Q9HA47 277 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SIGLEC16A6NMB1 481 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 FAM227AF5H4B4 570 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CHUKO15111 745 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MED7O43513 233 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5HO75947 161 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN12O95859 305 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HBQ1P09105 142 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CHN1P15882 459 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 IGFBP2P18065 325 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINA4P29622 427 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 GABRB2P47870 512 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MFAP5Q13361 173 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MORF4L2Q15014 288 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R7Q15435 360 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 GALNTL6Q49A17 601 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf22Q6V702 233 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CDC20BQ86Y33 519 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MIER2Q8N344 545 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM35BQ8NCS4 154 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF398Q8TD17 642 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP11Q8TF27 550 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-211ENST00000429595 MAML1Q92585 1016 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms