RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT78Q8N1N4 520 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORN4Q8NDC4 146 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2L5Q8NG80 312 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERINC2Q96SA4 455 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXXC4Q9H2H0 198 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9UFV3 132 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAPP1Q9UN19 280 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.2□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM221AA4D161 298 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESPNB1AK53 854 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYR61O00622 381 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNSO60931 367 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR1O75083 606 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPDP32754 393 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELK3P41970 407 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF5P43026 501 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNASE1L1P49184 302 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTTPP55157 894 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLX5P56178 289 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX4Q12846 297 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCN2Q14257 317 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYAL4Q2M3T9 481 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD17CQ6PCB6 329 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R5Q7Z5H4 357 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF321PQ8N8H1 164 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8K3Q8NH51 312 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTRT1Q8TDG2 376 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHBDF1Q96CC6 855 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGCZQ96LD1 299 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8D2Q9GZM6 311 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5DC2Q9H857 520 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa12.19□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKDD1BA6NHY2 528 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTAG2O75638 210 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELA3AP09093 270 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL3P10147 92 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH7P40394 386 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN2A2P49641 1150 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF4P78317 190 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXO1Q12778 655 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSNQ15631 228 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STEAP4Q687X5 459 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADNP2Q6IQ32 1131 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPN5Q6U736 354 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIX1LQ8IVB5 337 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC8AQ8IWT6 810 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDIK1LQ8N165 341 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A12Q8TD20 617 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD49Q8WVL7 239 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SARAFQ96BY9 339 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRC5BQ9NZH0 403 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG4BQ9Y4P1 393 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSAT1Q9Y617 370 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa12.18□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf105B2RV13 164 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUSD5O60279 629 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6AP2O75787 350 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P04436 131 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R39P59534 338 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERTAD2Q14140 314 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WLSQ5T9L3 541 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSKQ6UWY0 536 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5L2Q8NGL0 311 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1191Q96A73 305 aa12.17□□□□□ -0.46
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PWWP2AQ96N64 755 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms