RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413522.1

SNORD56-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56-201ENST00000413522 GSTA2P09210 222 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CPA3P15088 417 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 COPB2P35606 906 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PEX19P40855 299 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PTGER3P43115 390 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ASIC1P78348 528 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ACY1Q03154 408 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RPS6KA1Q15418 735 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF789Q5FWF6 425 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CARM1Q86X55 608 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CDC20BQ86Y33 519 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SIAH3Q8IW03 269 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PHC2Q8IXK0 858 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 BANPQ8N9N5 519 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FIBINQ8TAL6 211 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SPATA18Q8TC71 538 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 GANCQ8TET4 914 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 NABP1Q96AH0 204 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ULK4Q96C45 1275 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FAM210AQ96ND0 272 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ANKRD27Q96NW4 1050 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PANX3Q96QZ0 392 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 DESI2Q9BSY9 194 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CCDC28BQ9BUN5 200 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 OCR1Q9BZK8 76 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 NMUR1Q9HB89 426 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 DEPPQ9NTK1 212 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CNIH4Q9P003 139 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 THYN1Q9P016 225 aa2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SERINC4A6NH21 518 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CCER2I3L3R5 266 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 K7EQG2 157 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FBP2O00757 339 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CHUKO15111 745 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 GAS8O95995 478 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ODC1P11926 461 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 MUTP22033 750 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 IL4RP24394 825 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 LMO2P25791 158 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ATP5DP30049 168 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ID1P41134 155 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SLC1A4P43007 532 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 KHKP50053 298 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ITPK1Q13572 414 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RCN2Q14257 317 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SLMAPQ14BN4 828 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SPHARQ15513 63 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 MUC21Q5SSG8 566 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 SPINK14Q6IE38 97 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 NEPROQ6NW34 567 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF774Q6NX45 483 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 KCTD9Q7L273 389 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ASPGQ86U10 573 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RPAINQ86UA6 219 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CACUL1Q86Y37 369 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ERC1Q8IUD2 1116 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM126BQ8IUX1 230 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 LAX1Q8IWV1 398 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 GGHQ92820 318 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 FUT8Q9BYC5 575 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD56-201ENST00000413522 ACPTQ9BZG2 426 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms