RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 REEP3Q6NUK4 255 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TRIM74Q86UV6 250 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 UBE2FQ969M7 185 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 NEURL3Q96EH8 262 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CRELD1Q96HD1 420 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 FAM129BQ96TA1 746 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SH3D21A4FU49 640 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 AXIN1O15169 862 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 IL3P08700 152 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DDCP20711 480 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 BCAP31P51572 246 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CDH12P55289 794 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 OXA1LQ15070 435 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MFSD4AQ8N468 514 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MYADMQ96S97 322 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 HDAC8Q9BY41 377 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DYRK4Q9NR20 520 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 KCND3Q9UK17 655 aa22.67■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PRRT4C9JH25 899 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CBLP22681 906 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CD97P48960 835 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 VBP1P61758 197 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 NFE2L1Q14494 772 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SAXO2Q658L1 398 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 C17orf64Q86WR6 236 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 GGHQ92820 318 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 NXPE3Q969Y0 559 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 COL21A1Q96P44 957 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TMEM245Q9H330 911 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DEC1Q9P2X7 70 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ASF1AQ9Y294 204 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TRIOO75962 3097 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MAN1A2O60476 641 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MMP20O60882 483 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 OPN1SWP03999 348 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 OLR1P78380 273 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 DGCR6Q14129 220 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.66■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 EFCAB9A8MZ26 197 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CCNB2O95067 398 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 VIPP01282 170 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 GBAP04062 536 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 IFNW1P05000 195 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 LCKP06239 509 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ALOX5P09917 674 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA8P43361 318 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 TFF2Q03403 129 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 AMZ2Q86W34 360 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 HLA-CQ95604 372 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.65■■□□□ 1.22
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PMS1-205ENST00000409985 BTBD2Q9BX70 525 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MS4A8Q9BY19 250 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MMP27Q9H306 513 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.65■■□□□ 1.22
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PMS1-205ENST00000409985 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa22.65■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.64■■□□□ 1.22
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PMS1-205ENST00000409985 PLK4O00444 970 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 MBTPS2O43462 519 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PDE9AO76083 593 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 GADD45GO95257 159 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 FUCA1P04066 466 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 METAP1P53582 386 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 IRF3Q14653 427 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PLD3Q8IV08 490 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.64■■□□□ 1.22
PMS1-205ENST00000409985 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.64■■□□□ 1.22
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