RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379214.8

LGR4-201, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LGR4, Length 5,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4-201ENST00000379214 UTS2BQ765I0 119 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 NUP43Q8NFH3 380 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GBAP04062 536 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GSTT2P0CG29 244 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.873e-8■■□□□ 13.9
LGR4-201ENST00000379214 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 TBPL1P62380 186 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ADAM17P78536 824 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CHAF1BQ13112 559 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 MADCAM1Q13477 382 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.875e-6■■□□□ 12.3
LGR4-201ENST00000379214 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 TMEM203Q969S6 136 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CH25HO95992 272 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GKP32189 559 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 BNIP3Q12983 259 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CCDC115Q96NT0 180 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RHCEP18577 417 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CDH15P55291 814 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 DHCR24Q15392 516 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GAL3ST1Q99999 423 aa20.47■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 TYRP1P17643 537 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 A8MU76 341 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 DUX1O43812 170 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ITGA5P08648 1049 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GAS6Q14393 721 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CARTPTQ16568 116 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 THAP6Q8TBB0 222 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 KCNN1Q92952 543 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 H3BSA7 217 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 GBX1Q14549 363 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SFT2D3Q587I9 215 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 BMFQ96LC9 184 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 HCKP08631 526 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 MAB21L1Q13394 359 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SLC36A3Q495N2 470 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 KANK2Q63ZY3 851 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 TRIM74Q86UV6 250 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SCML4Q8N228 414 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RAB8BQ92930 207 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RNF186Q9NXI6 227 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.46■□□□□ 0.87
LGR4-201ENST00000379214 RNF13O43567 381 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 DIRAS1O95057 198 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 SOX14O95416 240 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 S1PR1P21453 382 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 PDHA2P29803 388 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 GLS2Q9UI32 602 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 UNC119BA6NIH7 251 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 SPINT3P49223 89 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 ARPC4P59998 168 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 NSMAFQ92636 917 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 A0A1W2PQU0 124 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 E7EQ34 232 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 CSTAP01040 98 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 PRKCDQ05655 676 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 PMS2P3Q13401 168 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 DOC2AQ14183 400 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 GK3PQ14409 553 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LGR4-201ENST00000379214 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms