RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ZFAND5O76080 213 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 TYK2P29597 1187 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CHRNB4P30926 498 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PTGER1P34995 402 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 GGT5P36269 586 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 KIR3DL1P43629 444 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 HSD17B7P56937 341 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 BTN3A2P78410 334 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 BTG2P78543 158 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PLGLB1Q02325 96 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 TGM3Q08188 693 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SLC13A2Q13183 592 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ACAD11Q709F0 780 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SHISA5Q8N114 240 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 C7orf57Q8NEG2 295 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CCT6BQ92526 530 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 GAL3ST3Q96A11 431 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ISL2Q96A47 359 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CAPS2Q9BXY5 557 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 HPF1Q9NWY4 346 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CD274Q9NZQ7 290 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ZNF180Q9UJW8 692 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 RNF112Q9ULX5 631 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.1□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 POLQO75417 2590 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 A0A087X1B8 175 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 TRIM49D1C9J1S8 452 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 UBXN8O00124 270 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 B3GALT2O43825 422 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 HS6ST1O60243 411 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 WISP2O76076 250 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 WDR47O94967 919 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 KLHL2O95198 593 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 MTHFD2P13995 350 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 HSPA7P48741 367 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SERPINB8P50452 374 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SERPINB9P50453 376 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 HCFC1P51610 2035 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CA13Q8N1Q1 262 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PDPRQ8NCN5 879 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 STAG3L4Q8TBR4 150 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ASB15Q8WXK1 588 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 EXT2Q93063 718 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 VPS11Q9H270 941 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 NECTIN3Q9NQS3 549 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 MED13LQ71F56 2210 aa13.09□□□□□ -0.31
CITED1-202ENST00000373619 ANKDD1BA6NHY2 528 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 KERAO60938 352 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 KRT38O76015 456 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 B3GALT4O96024 378 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SHBGP04278 402 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 IFNA16P05015 189 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CD1EP15812 388 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 EPORP19235 508 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 RAB38P57729 211 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 VSNL1P62760 191 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 HYAL2Q12891 473 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CDKL4Q5MAI5 379 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CES4AQ5XG92 561 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TRIM40Q6P9F5 258 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 GK5Q6ZS86 529 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ZNF595Q8IYB9 648 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CLYBLQ8N0X4 340 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD53Q8N9V6 530 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 OR5M3Q8NGP4 307 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 NCLNQ969V3 563 aa13.08□□□□□ -0.32
CITED1-202ENST00000373619 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms