RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 E9PQ18 207 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDHXO00330 501 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 KINO60870 393 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GMNNO75496 209 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 POP4O95707 220 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPP00491 289 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPRP00739 348 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNGP07510 517 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCP11498 1178 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 FHITP49789 147 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCR4P51679 360 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMSP52788 366 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPRL3Q12980 569 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPA4Q13156 261 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENPP2Q13822 863 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GIT2Q14161 759 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEPACAMQ14CZ8 416 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF146Q15072 292 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEPROQ6NW34 567 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARM1Q86X55 608 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACUL1Q86Y37 369 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4N5Q8IXE1 308 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8N377 158 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf52Q96A22 123 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF597Q96LX8 424 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATOH8Q96SQ7 321 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 S1PR3Q99500 378 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATF6BQ99941 703 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGPAT1Q99943 283 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 OCR1Q9BZK8 76 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 WWP1Q9H0M0 922 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SP140LQ9H930 580 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1A2Q9Y585 309 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX5Q9Y5X3 404 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNED1Q8TER0 1413 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5H15A6NDH6 313 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHISA7A6NL88 538 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 OGTO15294 1046 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMD3O43242 534 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PI15O43692 258 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V1G1O75348 118 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA9O76027 345 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMOX1P09601 288 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPBGLP0DKB5 382 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A8P0DMV1 189 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A9P0DMV2 189 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPX3P22352 226 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 STIP1P31948 543 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GEMP55040 296 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 UCP2P55851 309 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABPAQ06546 454 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAX8Q06710 450 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPA14Q0VDF9 509 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEF2DQ14814 521 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT31Q15323 416 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX1AQ16623 288 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A2Q5DJT8 189 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC10A5Q5PT55 438 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC21Q5SSG8 566 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 B3GLCTQ6Y288 498 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF410Q86VK4 478 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms