RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 RAD9AQ99638 391 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PTPN18Q99952 460 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JMP0 313 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TBX1O43435 398 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IFNA2P01563 188 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ASGR2P07307 311 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IL1R2P27930 398 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CREB5Q02930 508 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PDSS2Q86YH6 399 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GUL6 1792 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 EMC8O43402 210 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN7O95471 211 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 G6PDP11413 515 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 STOML3Q8TAV4 291 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IGSF21Q96ID5 467 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 B8ZZF3 427 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RNF13O43567 381 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 DGKEP52429 567 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PHF19Q5T6S3 580 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 WDR92Q96MX6 357 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 EBF4Q9BQW3 602 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LEFTY2O00292 366 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ITGB1P05556 798 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PRPS1P60891 318 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CD93Q9NPY3 652 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MTMR11A4FU01 709 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 EFCAB7A8K855 629 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CCL22O00626 93 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 BPNT1O95861 308 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 HEXBP07686 556 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 MC1RQ01726 317 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OGFOD2Q6N063 350 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 BIRC8Q96P09 236 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 HTR1EP28566 365 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 FOXN2P32314 431 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 HMGCLP35914 325 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 PCLAFQ15004 111 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRT-201ENST00000356100 OR2L2Q8NH16 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRT-201ENST00000356100 C17orf50Q8WW18 174 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TM9SF4Q92544 642 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TOR3AQ9H497 397 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 TBX10O75333 385 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 UBL4AP11441 157 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 NPR2P20594 1047 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 RCAN2Q14206 197 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-201ENST00000356100 CHRNA6Q15825 494 aa5.79□□□□□ -1.48
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