RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CHRDQ9H2X0 955 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TBC1D17Q9HA65 648 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0J9YVX5 310 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PR48 441 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 B4DGG1 531 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 G3V2T6 193 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CTSVO60911 334 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 AIFM1O95831 613 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 LSSP48449 732 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PRIM2P49643 509 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ALDH3A2P51648 485 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ARSFP54793 590 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 BTN3A2P78410 334 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KCT2Q8NC54 265 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NEURL3Q96EH8 262 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TPD52L3Q96J77 140 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 OR2A5Q96R48 311 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 GLOD5A6NK44 160 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 P2RX6O15547 441 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HPRP00739 348 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FABP3P05413 133 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ARAFP10398 606 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PVRP15151 417 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 MAOBP27338 520 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CD38P28907 300 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NTSP30990 170 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 DSTNP60981 165 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CDK6Q00534 326 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HHEXQ03014 270 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZP2Q05996 745 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 MLC1Q15049 377 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SLC36A3Q495N2 470 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 C18orf63Q68DL7 685 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 GJD3Q8N144 294 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CADM4Q8NFZ8 388 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CYGBQ8WWM9 190 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 THAP11Q96EK4 314 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 VNN3Q9NY84 501 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.8□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0J9YY10 115 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 WASHC1A8K0Z3 465 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SUV39H1O43463 412 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 NOBOXO60393 691 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 E2F6O75461 281 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 FKBP9O95302 570 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TNFAIP8O95379 198 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SNAP29O95721 258 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM18P0DKX4 95 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CAPGP40121 348 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 DCTP40126 519 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CLCN2P51788 898 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 KRT80Q6KB66 452 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC80Q76M96 950 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.79□□□□□ -0.52
ZNF548-201ENST00000336128 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms