RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 COX10Q12887 443 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CDH18Q13634 790 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF284Q2VY69 593 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ADGRG3Q86Y34 549 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MAL2Q969L2 176 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 WACQ9BTA9 647 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 COMMD3Q9UBI1 195 aa17.38■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MYO16Q9Y6X6 1858 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MAGEB17A8MXT2 336 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 FABP7O15540 132 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 VNN2O95498 520 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ARSBP15848 533 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CRYBB2P43320 205 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MAP2K6P52564 334 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CYP4F8P98187 520 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 FUT10Q6P4F1 479 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PTOV1Q86YD1 416 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 GPR65Q8IYL9 337 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 KCNJ9Q92806 393 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ASIC4Q96FT7 647 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 KLHL15Q96M94 604 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ELOVL2Q9NXB9 296 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 NUDT7P0C024 238 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 RHOQP17081 205 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ACVRL1P37023 503 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ERVK-21P61565 698 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 KCNJ10P78508 379 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF273Q14593 569 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 GRK1Q15835 563 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 C22orf42Q6IC83 251 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 SBSNQ6UWP8 590 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TRIM46Q7Z4K8 759 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 FBXO32Q969P5 355 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 UPRTQ96BW1 309 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 EXOC2Q96KP1 924 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ACPTQ9BZG2 426 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 HRH3Q9Y5N1 445 aa17.37■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 UPK3BL1B0FP48 263 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 UPK3BL2E5RIL1 263 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 INPPL1O15357 1258 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PROM1O43490 865 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 GALTP07902 379 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 DGKKQ5KSL6 1271 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ARTNQ5T4W7 220 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 BBS7Q8IWZ6 715 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TEX26Q8N6G2 289 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A46Q96AG3 418 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ING4Q9UNL4 249 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 E9PQ18 207 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TAPBPO15533 448 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PLOD3O60568 738 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 OR5F1O95221 314 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZXDBP98169 803 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 SCRN3Q0VDG4 424 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 HKDC1Q2TB90 917 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 C10orf120Q5SQS8 335 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CARNMT1Q8N4J0 409 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 APOLD1Q96LR9 279 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 GPR137Q96N19 417 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.36■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 LYRM1O43325 122 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 EPB42P16452 691 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 F8A1P23610 371 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MON1AQ86VX9 555 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 UFD1Q92890 307 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PTP4A1Q93096 173 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 AP2M1Q96CW1 435 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 EBPLQ9BY08 206 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 HYKKA2RU49 373 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 MTMR11A4FU01 709 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 CSO75390 466 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
PKP3-201ENST00000331563 PDYNP01213 254 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms