RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OR9Q2Q8NGE9 314 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLCO2A1Q92959 643 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ESAMQ96AP7 390 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PCED1BQ96HM7 432 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SPASTQ9UBP0 616 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KLK11Q9UBX7 282 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NUDCQ9Y266 331 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C19orf81C9J6K1 198 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 RNF103O00237 685 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRPSAP2O60256 369 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZG16O60844 167 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 STAM2O75886 525 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FGF19O95750 216 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TXNDC12O95881 172 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TPBGLP0DKB5 382 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CT45A8P0DMV1 189 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CT45A9P0DMV2 189 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF18P17022 549 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PDHA2P29803 388 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 OR1C1Q15619 314 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 WLSQ5T9L3 541 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 LIPHQ8WWY8 451 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ART5Q96L15 291 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 GPR137Q96N19 417 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 USP28Q96RU2 1077 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KRT12Q99456 494 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MED17Q9NVC6 651 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CFAP73A6NFT4 308 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KRT86O43790 486 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 LRP3O75074 770 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ETS1P14921 441 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KRT81Q14533 505 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MEF2DQ14814 521 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 KIF6Q6ZMV9 814 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM186Q96B77 213 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 WWP1Q9H0M0 922 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 C1orf21Q9H246 121 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 GANQ9H2C0 597 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NLGN3Q9NZ94 848 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 NARFQ9UHQ1 456 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.53□□□□□ -1.84
ZNF404-201ENST00000324394 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 LINC01565O15544 149 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 EDIL3O43854 480 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CSO75390 466 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 PGK2P07205 417 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 SFTPBP07988 381 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CCDC192P0DO97 292 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 ACP1P24666 158 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 RPA1P27694 616 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 AKT2P31751 481 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 TNFRSF4P43489 277 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 FHITP49789 147 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 GEMP55040 296 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CCZ1BP86790 482 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 GAMTQ14353 236 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 NEK5Q6P3R8 708 aa3.52□□□□□ -1.85
ZNF404-201ENST00000324394 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms