RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 TMCC2O75069 709 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TNFRSF1BP20333 461 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 GGT2P36268 569 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ETV6P41212 452 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ITGA1P56199 1179 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 DUSP7Q16829 419 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 IER5LQ5T953 404 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ASB11Q8WXH4 323 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 AP2M1Q96CW1 435 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RNF170Q96K19 258 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RAD9AQ99638 391 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 UCK2Q9BZX2 261 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SLC32A1Q9H598 525 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ACOXLQ9NUZ1 547 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SMIM30A4D0T7 59 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TNFRSF11BO00300 401 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 KIAA0355O15063 1070 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SGTAO43765 313 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 MMP20O60882 483 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 EPN2O95208 641 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ELFN1P0C7U0 828 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SSTR4P31391 388 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 UQCRC1P31930 480 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SOX3P41225 446 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 DGKGP49619 791 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 FAHD1Q6P587 224 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 NLRP8Q86W28 1048 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SLC5A8Q8N695 610 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 GPR156Q8NFN8 814 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 FRMD6Q96NE9 622 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 LINC01553A4QN01 128 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 AGAP14A8MT82 685 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 FPGTO14772 594 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 GPX5O75715 221 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 SLC16A8O95907 504 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 OPN1SWP03999 348 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CA3P07451 260 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CD9P21926 228 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CBLP22681 906 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 POU1F1P28069 291 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CSNK1DP48730 415 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 LBX1P52954 281 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ZNF79Q15937 498 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 BTBD16Q32M84 506 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 VN1R5Q7Z5H4 357 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 KRT73Q86Y46 540 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 FAM20CQ8IXL6 584 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ASB15Q8WXK1 588 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 LYSMD1Q96S90 227 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 RLIMQ9NVW2 624 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 KLK4Q9Y5K2 254 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 E7EQ34 232 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 AKR7A2O43488 359 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CD22P20273 847 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 KIR3DL1P43629 444 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 CDH12P55289 794 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 HOXC5Q00444 222 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 IRF8Q02556 426 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 FAPQ12884 760 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 EFR3AQ14156 821 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 QPRTQ15274 297 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ZNF77Q15935 545 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 XKR6Q5GH73 641 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 ZNF367Q7RTV3 350 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC27-201ENST00000317907 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms