RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 COQ8BQ96D53 544 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 WDR41Q9HAD4 459 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 EHD3Q9NZN3 535 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 TBX19O60806 448 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 DNAJB6O75190 326 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 UNC5CO95185 931 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 AIFM1O95831 613 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 HBQ1P09105 142 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 NR2F6P10588 404 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 CPA2P48052 419 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 MMP21Q8N119 569 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 RTKNQ9BST9 563 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCDC71L-201ENST00000315965 SEC16AO15027 2179 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CHST10O43529 356 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 TIAF1O95411 115 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 LAMP1P11279 417 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB38P57729 211 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 COQ5Q5HYK3 327 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 C18orf63Q68DL7 685 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RCN3Q96D15 328 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 OR52E6Q96RD3 313 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CTRCQ99895 268 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 DUSP26Q9BV47 211 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB15P59190 212 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 REP15Q6BDI9 236 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 DSELQ8IZU8 1212 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 NATD1Q8N6N6 113 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC187A0A096LP49 1063 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 FBP2O00757 339 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 AIM2O14862 343 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RASSF2P50749 326 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 SHC2P98077 582 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 TLR1Q15399 786 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MAPKAPK3Q16644 382 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM47BQ8NA70 645 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CLIP3Q96DZ5 547 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CSF3RQ99062 836 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 NPAS2Q99743 824 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RMND5AQ9H871 391 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.68■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 GLOD5A6NK44 160 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 JMJD7P0C870 316 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 OR1D4P47884 311 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PHC1P78364 1004 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 DSG2Q14126 1118 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF385BQ569K4 471 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 C1orf189Q5VU69 101 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC48A1Q6P1K1 146 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PSME2Q9UL46 239 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 KNTC1P50748 2209 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ASPDHA6ND91 283 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 B2RBV5 119 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 CYR61O00622 381 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MRASO14807 208 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 PGRMC2O15173 223 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ITIH1P19827 911 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 MXRA7P84157 204 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 ART3Q13508 389 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 RETREG3Q86VR2 466 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC71L-201ENST00000315965 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms