RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CST6Q15828 149 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 DUSP6Q16828 381 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SAXO2Q658L1 398 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 REEP3Q6NUK4 255 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 Q6ZNX1 250 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 KLK6Q92876 244 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NEURL3Q96EH8 262 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 CHFRQ96EP1 664 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 COPS4Q9BT78 406 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TEX101Q9BY14 249 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 WDR26Q9H7D7 661 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ACER3Q9NUN7 267 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 GDE1Q9NZC3 331 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ENPP4Q9Y6X5 453 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SLC22A1O15245 554 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NDUFS4O43181 175 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 LATO43561 262 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 BCHEP06276 602 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PXNP49023 591 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 VBP1P61758 197 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 CSNK2BP67870 215 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 DUSP7Q16829 419 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SLCO6A1Q86UG4 719 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PLD3Q8IV08 490 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 CCDC103Q8IW40 242 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PDXPQ96GD0 296 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 C12orf66Q96MD2 445 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.31■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PP55 124 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 OR2A25A4D2G3 310 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 C5orf58C9J3I9 102 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TMPRSS11DO60235 418 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SH3BP5O60239 455 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 GADD45GO95257 159 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RECKO95980 971 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 POU2F1P14859 743 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 OPRL1P41146 370 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ADCK2Q7Z695 626 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ZNF605Q86T29 641 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NUDT13Q86X67 352 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 QRFPRQ96P65 431 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ZNF556Q9HAH1 456 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RHCGQ9UBD6 479 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SNX11Q9Y5W9 270 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 A0A0G2JN53 185 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 M0R3G1 203 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TBX19O60806 448 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 CCNB2O95067 398 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SERPIND1P05546 499 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SERPINB1P30740 379 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 FGL2Q14314 439 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NR1D2Q14995 579 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SLC38A5Q8WUX1 472 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PROX1Q92786 737 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RGMAQ96B86 450 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 XKR8Q9H6D3 395 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 AMBNQ9NP70 447 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 MYO10Q9HD67 2058 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TOR1BO14657 336 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 FUCA1P04066 466 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 IFNW1P05000 195 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RHCEP18577 417 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 LIMS1P48059 325 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 YAF2Q8IY57 180 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RHOXF1Q8NHV9 184 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TMEM19Q96HH6 336 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NT5DC2Q9H857 520 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 NEUROD4Q9HD90 331 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 SELENONQ9NZV5 590 aa18.29■□□□□ 0.52
USP21-201ENST00000289865 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms