RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVI7 797 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K4P45985 399 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KANK2Q63ZY3 851 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SCML4Q8N228 414 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 E7EQ34 232 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR12D1P0DN82 309 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 E2F1Q01094 437 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SERINC5Q86VE9 423 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LATS1O95835 1130 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 EDNRBP24530 442 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HMGCLP35914 325 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LMAN2Q12907 356 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND11Q15326 602 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVT2 93 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CSF2P04141 144 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SGCDQ92629 289 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RDH8Q9NYR8 311 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PRODH2Q9UF12 536 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SOX30O94993 753 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA5P08648 1049 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-EP13747 358 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL33A6NCF5 533 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SOBPA7XYQ1 873 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 EMC8O43402 210 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ASGR2P07307 311 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FHP07954 510 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KCNC1P48547 511 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SNTA1Q13424 505 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SMOXQ9NWM0 555 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 VEGFDO43915 354 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PFKMP08237 780 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RCAN2Q14206 197 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OCLNQ16625 522 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RAB12Q6IQ22 244 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GKN2Q86XP6 184 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LNX2Q8N448 690 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR2L2Q8NH16 312 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DOC2AQ14183 400 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TSC22D1Q15714 1073 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MYRFLQ96LU7 910 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 STRA6Q9BX79 667 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 BMP2P12643 396 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GGT1P19440 569 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA12P43365 314 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HYAL2Q12891 473 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SLC36A3Q495N2 470 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM30A4D0T7 59 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HCKP08631 526 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GNG2P59768 71 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SPHARQ15513 63 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GRK1Q15835 563 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF778Q96MU6 729 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ARSDP51689 593 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GSTM4Q03013 218 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CES4AQ5XG92 561 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms