RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SIAEQ9HAT2 523 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TAC3Q9UHF0 121 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FABP12A6NFH5 140 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C1orf105O95561 183 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PCCBP05166 539 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ACADMP11310 421 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BMP7P18075 431 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DDCP20711 480 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OXA1LQ15070 435 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.46□□□□□ -1.05
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HERC3-201ENST00000264345 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GPR83Q9NYM4 423 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MGAMO43451 1857 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CXCL10P02778 98 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM25Q86YD3 366 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RNFT2Q96EX2 444 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ASPNQ9BXN1 380 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HCSTQ9UBK5 93 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 MPIP34949 423 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 DTD2Q96FN9 168 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ING3Q9NXR8 418 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 INSL6Q9Y581 213 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DYRK3O43781 588 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ13O60928 360 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF12O95522 483 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 CAPZA2P47755 286 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CASP9P55211 416 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.45□□□□□ -1.06
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HERC3-201ENST00000264345 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 VNN2O95498 520 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RHAGQ02094 409 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ST3GAL3Q11203 375 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TRAM2Q15035 370 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PLET1Q6UQ28 207 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GALNT10Q86SR1 603 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WBP2Q969T9 261 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FKBP10Q96AY3 582 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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