RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 RFX3P48380 749 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CLCNKBP51801 687 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 DIO3P55073 304 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 RAP2BP61225 183 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACTA2P62736 377 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACTG2P63267 376 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACTC1P68032 377 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACTA1P68133 377 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CDNFQ49AH0 187 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ATCAYQ86WG3 371 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLC35F3Q8IY50 421 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TCEANCQ8N8B7 351 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TSPEARQ8WU66 669 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 NSMAFQ92636 917 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PRO1933Q9H354 126 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.26□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 B4DXG7 233 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 E7EQ34 232 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 GOSR2O14653 212 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PRKYO43930 277 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 AHSA1O95433 338 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 S100A11P31949 105 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 NRIP1P48552 1158 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLC6A3Q01959 620 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 LRFN5Q96NI6 719 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM175Q9BSA9 504 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PIM2Q9P1W9 311 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GV50 99 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 E7ESA3 106 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 M0R2N6 131 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TNFRSF10BO14763 440 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SNHG28P0DPA3 235 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACPPP15309 386 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 EPORP19235 508 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 UGT2B10P36537 528 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 COQ5Q5HYK3 327 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 FAM220AQ7Z4H9 259 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 APOLD1Q96LR9 279 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 RAD9AQ99638 391 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 VAPAQ9P0L0 249 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLX4Q8IY92 1834 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MROH6A6NGR9 719 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 IL33O95760 270 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 TSPAN15O95858 294 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 C1RP00736 705 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CAPN3P20807 821 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 NMBRP28336 390 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 AXLP30530 894 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CPT1AP50416 773 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PPT1P50897 306 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MAJINQ3KP22 176 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MARC2Q969Z3 335 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ESAMQ96AP7 390 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MEMO1Q9Y316 297 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PTPRJQ12913 1337 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SLC12A8A0AV02 714 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ACOT8O14734 319 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SOX14O95416 240 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 C6P13671 934 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 CPT2P23786 658 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 PAX6P26367 422 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 GKP32189 559 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 AQP2P41181 271 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SOX3P41225 446 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 FABP9Q0Z7S8 132 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 AMHR2Q16671 573 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 Q3C1V9 767 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 FAM26DQ5JW98 314 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SPRED1Q7Z699 444 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 FAM83AQ86UY5 434 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 MED16Q9Y2X0 877 aa10.25□□□□□ -0.77
KPNA3-201ENST00000261667 SIPA1L1O43166 1804 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms