RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 HM13Q8TCT9 377 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SNX7Q9UNH6 387 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PTNP21246 168 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 EPS8Q12929 822 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 C11orf65Q8NCR3 313 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PBX4Q9BYU1 374 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GLS2Q9UI32 602 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PPM1DO15297 605 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SYNGR4O95473 234 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 IGFBP5P24593 272 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ARL3P36405 182 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NAXEQ8NCW5 288 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ASB16Q96NS5 453 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 HHIPQ96QV1 700 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1W2PRB8 838 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 FAM25AB3EWG3 89 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 FAM25CB3EWG5 89 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 FAM25GB3EWG6 89 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PSMD9O00233 223 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TEX19Q8NA77 164 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 FAM129BQ96TA1 746 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GPER1Q99527 375 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 MUC13Q9H3R2 512 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 C3orf18Q9UK00 162 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SPATA2Q9UM82 520 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 IFT52Q9Y366 437 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 A0A096LPI6 279 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 M0R129 80 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CISD3P0C7P0 127 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 OPRD1P41143 372 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GALK2Q01415 458 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CST6Q15828 149 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NAGSQ8N159 534 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 OLAHQ9NV23 265 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SIP14410 1827 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 AREL1O15033 823 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SLC16A5O15375 505 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 RB1P06400 928 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 EPHA5P54756 1037 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CTBP2P56545 445 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CBX3Q13185 183 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GAB1Q13480 694 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 GFYI3L273 518 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 MAGEB3O15480 346 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TPST2O60704 377 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 ETFAP13804 333 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NT5EP21589 574 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 NUDT6P53370 316 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PRSS36Q5K4E3 855 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SMPDL3AQ92484 453 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD2-201ENST00000249700 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms