RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 RND1Q92730 232 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 HPF1Q9NWY4 346 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 MOCS1Q9NZB8 636 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 NF1P21359 2839 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 PINLYPA6NC86 204 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 TOXO94900 526 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 OR6B1O95007 311 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 PAOXQ6QHF9 649 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 IL20RBQ6UXL0 311 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 VN1R5Q7Z5H4 357 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 OR2M7Q8NG81 312 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 ASB15Q8WXK1 588 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 SERINC2Q96SA4 455 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 UCK2Q9BZX2 261 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 HCFC1P51610 2035 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRF-216ENST00000617451 NKX2-6A6NCS4 301 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ANKDD1BA6NHY2 528 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CTNSO60931 367 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 LIM2P55344 173 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ARL4CP56559 192 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 BMPR2Q13873 1038 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD17CQ6PCB6 329 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 HSDL2Q6YN16 418 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 VPS39Q96JC1 886 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 RASL10BQ96S79 203 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CSF3RQ99062 836 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 EHD1Q9H4M9 534 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ16Q9NPI9 418 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 DAPP1Q9UN19 280 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FAM90A27PA6NNH2 459 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 IFNA16P05015 189 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CERS1P27544 350 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MSX1P28360 303 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 GGT5P36269 586 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 SOX3P41225 446 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MTTPP55157 894 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PLGLB1Q02325 96 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PMPCAQ10713 525 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TGFBIQ15582 683 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MORN4Q8NDC4 146 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 DERL2Q9GZP9 239 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 RHOJQ9H4E5 214 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JMM0 328 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPB8 328 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRS3 328 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FAM166BA8MTA8 275 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 KIR3DP1A8MWS1 328 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ACOT7O00154 380 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 WWP2O00308 870 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TP73O15350 636 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TAPBPO15533 448 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF4O60810 478 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NUP107P57740 925 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 RCN2Q14257 317 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.295e-6■■■□□ 16.7
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PTPRF-216ENST00000617451 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ACAD11Q709F0 780 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TTTY12Q9BZ98 90 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM7Q9NQW5 492 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA2E9PIF3 369 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA3F8WFD2 350 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
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