RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 OARD1Q9Y530 152 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 NF1P21359 2839 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT2O43825 422 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 GNAZP19086 355 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ELK3P41970 407 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G16P53816 162 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 BMPR2Q13873 1038 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF595Q8IYB9 648 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PSAT1Q9Y617 370 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CYR61O00622 381 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK8O60259 260 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A12P48065 614 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 HK2P52789 917 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF750Q32MQ0 723 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ADNP2Q6IQ32 1131 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R5Q7Z5H4 357 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A16Q86VW1 577 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLQ8NG68 377 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD49Q8WVL7 239 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD7Q92527 254 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SMC6Q96SB8 1091 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM215AQ9Y5M1 114 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA16P05015 189 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ACVR2AP27037 513 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS1P27544 350 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 HNMTP50135 292 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 LIM2P55344 173 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBPHQ13203 477 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TSNQ15631 228 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ADPRMQ3LIE5 342 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CES4AQ5XG92 561 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 STEAP4Q687X5 459 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF585AQ6P3V2 769 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 HSDL2Q6YN16 418 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM251Q8N6I4 163 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2L5Q8NG80 312 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDF1Q96CC6 855 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 SCYL1Q96KG9 808 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TTYH2Q9BSA4 534 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DAPP1Q9UN19 280 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A088AWK7 358 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14I1A6ND48 311 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC3AO75596 197 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHG3P01860 377 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IVDP26440 423 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA5P43359 124 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL6Q6ICC9 239 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GK5Q6ZS86 529 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 POM121Q96HA1 1249 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SERINC2Q96SA4 455 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM173AQ9BQD7 235 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MTORP42345 2549 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FIGNL2A6NMB9 653 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 BCKDKO14874 412 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF4O60810 478 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CELA3AP09093 270 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GLI4P10075 376 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CNR1P21554 472 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTM2P28161 218 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R39P59534 338 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD17CQ6PCB6 329 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL4Q6ZR62 310 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FRA10AC1Q70Z53 315 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TRILQ7L0X0 811 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CLYBLQ8N0X4 340 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PDIK1LQ8N165 341 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT78Q8N1N4 520 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM109AQ8N4B1 249 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MORN4Q8NDC4 146 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5DC2Q9H857 520 aa23.75■■□□□ 1.39
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