RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 LGI4Q8N135 537 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ELP5Q8TE02 316 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ISL2Q96A47 359 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 RGMAQ96B86 450 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 MTBPQ96DY7 904 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 C5orf34Q96MH7 638 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR78Q96P69 363 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC77Q9BR77 488 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 LYRM4Q9HD34 91 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF358Q9NW07 568 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 XPR1Q9UBH6 696 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 BLACEA4D250 179 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 GABRR3A8MPY1 467 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CDK2AP1O14519 115 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 FCHO1O14526 889 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CTNSO60931 367 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CLDN9O95484 217 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CPN2P22792 545 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGEA12P43365 314 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CCNG1P51959 295 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TUBA3CQ13748 450 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TERF2Q15554 542 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TEX35Q5T0J7 233 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CNPY4Q8N129 248 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 OR51B5Q9H339 312 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 RELNP78509 3460 aa15.05■□□□□ 0
EFTUD2-215ENST00000589825 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 H0YIV9 168 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 E2F3O00716 465 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 STX16O14662 325 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 RIPK2O43353 540 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 TNNI3P19429 210 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 SERTAD2Q14140 314 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 OR1C1Q15619 314 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 VMP1Q96GC9 406 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 KLHL1Q9NR64 748 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 LRFN1Q9P244 771 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 FLNCQ14315 2725 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 CYR61O00622 381 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 SEMA7AO75326 666 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 MLYCDO95822 493 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 DDAH2O95865 285 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 TAC1P20366 129 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 CD96P40200 585 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 CYB561P49447 251 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 SLAMF1Q13291 335 aa15.04■□□□□ -0
EFTUD2-215ENST00000589825 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms