RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CARM1	Q86X55	608 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ALG14	Q96F25	216 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ITCH	Q96J02	903 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DPY30	Q9C005	99 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MYLK	Q15746	1914 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A096LPI6	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00473	A8K010	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PDLIM1	O00151	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ARPC2	O15144	300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1I1	O60431	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC22B	O75396	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM16	O95361	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CD160	O95971	181 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CTSA	P10619	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IRF1	P10914	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	G6PD	P11413	515 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPAN8	P19075	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPN3	P20807	821 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ITPKB	P27987	946 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A3	P33764	101 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HNF1B	P35680	557 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPG	P40121	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HNF4A	P41235	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CSK	P41240	450 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP2	P42575	452 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ASMT	P46597	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RGR	P47804	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ERF	P50548	548 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CCT8	P50990	548 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD23A	P54725	363 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DIO3	P55073	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN8	P56748	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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