RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.29□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.29□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.29□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 OR56A3Q8NH54 315 aa4.29□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.29□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 SDR42E2A6NKP2 422 aa4.28□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.28□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 ARPC5O15511 151 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 SUV39H1O43463 412 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 MED7O43513 233 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 CHST10O43529 356 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 LIASO43766 372 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 OR10H3O60404 316 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 SELENOFO60613 162 aa4.28□□□□□ -1.72
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C15orf40-210ENST00000563387 MMP20O60882 483 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 MTX2O75431 263 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 CREG1O75629 220 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PIAS1O75925 651 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 RAD17O75943 681 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 ATG12O94817 140 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PRAMEF12O95522 483 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 TBX18O95935 607 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 IFNA17P01571 189 aa4.28□□□□□ -1.72
C15orf40-210ENST00000563387 PPBPP02775 128 aa4.28□□□□□ -1.72
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