RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXCR4P61073 352 aa20.3■□□□□ 0.84
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP2CAP67775 309 aa20.3■□□□□ 0.84
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPARTQ8N0X7 666 aa20.3■□□□□ 0.84
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH3GL3Q99963 347 aa20.3■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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