RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25	1e-7	■□□□□ 8.6
CS-229	ENST00000551936	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	CTNS	O60931	367 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ITGA10	O75578	1167 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	PRF1	P14222	555 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TFEB	P19484	476 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	CASP6	P55212	293 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	IRF8	Q02556	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	RAPH1	Q70E73	1250 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	EXT2	Q93063	718 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	UBXN8	O00124	270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KERA	O60938	352 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZFAND5	O76080	213 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	CRABP2	P29373	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	STX2	P32856	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MSH2	P43246	934 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MEOX1	P50221	254 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	HSF1	Q00613	529 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TGM3	Q08188	693 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NAB1	Q13506	487 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936		K7EPI3	171 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	PEX1	O43933	1283 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	TGFB1	P01137	390 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MTHFD2	P13995	350 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNF24	P17028	368 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	AGA	P20933	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	HTR1E	P28566	365 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	RCN2	Q14257	317 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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