RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 ITGAMP11215 1152 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 CERS1P27544 350 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 CCT5P48643 541 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4D2P58180 307 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC18A2Q05940 514 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 BIKQ13323 160 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 FRG2Q64ET8 278 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4C11Q6IEV9 310 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 CYP4X1Q8N118 509 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 FRG2BQ96QU4 278 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB21Q9UL25 225 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A0G2JN53 185 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC26A5P58743 744 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CLCQ05315 142 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC153Q494R4 210 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 OR51B5Q9H339 312 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MKS1Q9NXB0 559 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF225Q9UK10 706 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 EMCNQ9ULC0 261 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SAGE2PA6NJ88 616 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PLPP1O14494 284 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF33BQ06732 778 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TLR1Q15399 786 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 BTBD16Q32M84 506 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 UNC50Q53HI1 259 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 RDH11Q8TC12 318 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF382Q96SR6 550 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SERPINI1Q99574 410 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 BRF2Q9HAW0 419 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SLAMF7Q9NQ25 335 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAM29Q9UKF5 820 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TTLL8A6PVC2 850 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 H3BQF6 201 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 GOLGA8RI6L899 631 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MAOAP21397 527 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 BSGP35613 385 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR143P51810 404 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 IQCKQ8N0W5 287 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SPACA6W5XKT8 324 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TENM4Q6N022 2769 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 POLEQ07864 2286 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A0A6YYD5 115 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 G3V2L1 256 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MLYCDO95822 493 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PROCP04070 461 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CELA2AP08217 269 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 KRT15P19012 456 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SSR2P43308 183 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAJB13P59910 316 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SERTAD2Q14140 314 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 LETMD1Q6P1Q0 360 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CUZD1Q86UP6 607 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CPT1CQ8TCG5 803 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 CDK15Q96Q40 435 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM237Q96Q45 408 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 PHF11Q9UIL8 331 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ESPL1Q14674 2120 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 RELNP78509 3460 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SERTM1A2A2V5 107 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 DYTNA2CJ06 578 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-203ENST00000547701 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms