RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 VAMP2P63027 116 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 TAF10Q12962 218 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 STX5Q13190 355 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 DGCR6Q14129 220 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 C12orf29Q8N999 325 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.47□□□□□ -1.21
LMO3-212ENST00000535535 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 CHID1Q9BWS9 393 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-212ENST00000535535 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 COCHO43405 550 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TNFSF14O43557 240 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 STSP08842 583 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 SEC23BQ15437 767 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 STX1AQ16623 288 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 TMEM25Q86YD3 366 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.46□□□□□ -1.22
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LMO3-212ENST00000535535 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.46□□□□□ -1.22
LMO3-212ENST00000535535 SIX4Q9UIU6 781 aa7.46□□□□□ -1.22
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