RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	C8B	P07358	591 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CTBP1	Q13363	440 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SNX1	Q13596	522 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	EXO5	Q9H790	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MED12	Q93074	2177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FREM3	P0C091	2139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ROS1	P08922	2347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	AVIL	O75366	819 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TIMP3	P35625	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CETN2	P41208	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NPY2R	P49146	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CCR8	P51685	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PGGT1B	P53609	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CBLB	Q13191	982 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SNF8	Q96H20	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TIMP4	Q99727	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SMPD2	O60906	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LRAT	O95237	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NID1	P14543	1247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GRK3	P35626	688 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SOX18	P35713	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RNF4	P78317	190 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	BTN3A2	P78410	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FOXF2	Q12947	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CSF3R	Q99062	836 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	USF3	Q68DE3	2245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	HAUS5	O94927	633 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ETHE1	O95571	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FTCD	O95954	541 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557		P04436	131 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SORD	Q00796	357 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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