RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NFATC1	O95644	943 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GSTM3	P21266	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC8A1	P32418	973 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSD17B3	P37058	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CXCR3	P49682	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLCN5	P51795	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDH6	P55285	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CFHR1	Q03591	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSPB2	Q16082	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CAMK4	Q16566	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	AGK	Q53H12	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	M1AP	Q8TC57	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CGREF1	Q99674	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PRB8	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CHUK	O15111	745 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	COCH	O43405	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PMPCB	O75439	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSMB6	P28072	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADM	P35318	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	BPIFB4	P59827	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ELMO1	Q92556	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNF8	Q96H20	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MED30	Q96HR3	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMCC1	O94876	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	H6PD	O95479	791 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MT-ND2	P03891	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FCGR1A	P12314	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MLN	P12872	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPN1	P15169	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACKR3	P25106	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NUDT6	P53370	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NAPA	P54920	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MELK	Q14680	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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