RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516056.1

RNU6-518P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 518, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-518P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-518P-201ENST00000516056 ALKBH4Q9NXW9 302 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 OBP2AQ9NY56 170 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 HACD3Q9P035 362 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 UBQLN2Q9UHD9 624 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SMC3Q9UQE7 1217 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 MAU2Q9Y6X3 613 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TNCP24821 2201 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ACEP12821 1306 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 NEDD4P46934 1319 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 C11orf94C9JXX5 98 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ANHXE9PGG2 379 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 H0Y3Z8 333 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 KPNA5O15131 536 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 CHST1O43916 411 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PLA2G6O60733 806 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SAP30O75446 220 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TIMP1P01033 207 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SBK2P0C263 348 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4GP0DN37 164 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PDGFRAP16234 1089 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GNAQP50148 359 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 VCPP55072 806 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 KLC1Q07866 573 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 EFR3AQ14156 821 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 IHHQ14623 411 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SYPL1Q16563 259 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ALG11Q2TAA5 492 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GPR33Q49SQ1 333 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FGD3Q5JSP0 725 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPP4R4Q6NUP7 873 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 COMMD2Q86X83 199 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM114A1Q8IWE2 563 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF100Q8IYN0 542 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 CFAP206Q8IYR0 622 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 BATF2Q8N1L9 274 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 MAGEB6Q8N7X4 407 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TCEANCQ8N8B7 351 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TNIP2Q8NFZ5 429 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GSDMBQ8TAX9 411 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TRPC4APQ8TEL6 797 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PIK3R3Q92569 461 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM81BQ96LP2 452 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 LURAP1Q96LR2 239 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 RNF145Q96MT1 663 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 POLR3GLQ9BT43 218 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 HEMGNQ9BXL5 484 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ANGPTL4Q9BY76 406 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 RACGAP1Q9H0H5 632 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 MROH8Q9H579 483 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 EGLN3Q9H6Z9 239 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 KCNK13Q9HB14 408 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 NGBQ9NPG2 151 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GKN1Q9NS71 199 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SPG21Q9NZD8 308 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FZR1Q9UM11 496 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TBX22Q9Y458 520 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 OR51B4Q9Y5P0 310 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 LRP2P98164 4655 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FLNCQ14315 2725 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 AQP12BA6NM10 295 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 E7EQL1 145 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ARPC2O15144 300 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 PLXNB1O43157 2135 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 ANP32CO43423 234 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 MBD4O95243 580 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 FSTL3O95633 263 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 TBX18O95935 607 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 HOXA9P31269 272 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-518P-201ENST00000516056 UGT1A3P35503 534 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms