RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CBFA2T2O43439 604 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NRDCO43847 1150 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 IL18BPO95998 194 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 B3GALT4O96024 378 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 IFNB1P01574 187 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 APRTP07741 180 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MPC1LP0DKB6 136 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NID1P14543 1247 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GCKP35557 465 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CPOXP36551 454 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PIGAP37287 484 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HNF4AP41235 474 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PTH2RP49190 550 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HK2P52789 917 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 DIO3P55073 304 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GDF10P55107 478 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 WNT3P56703 355 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RAB8AP61006 207 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NAE1Q13564 534 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CUL1Q13616 776 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ACKR1Q16570 336 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 XKR6Q5GH73 641 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LUZP2Q86TE4 346 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MEIOBQ8N635 442 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRELID2Q8N945 189 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ASB11Q8WXH4 323 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 LPGAT1Q92604 370 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 NTNG2Q96CW9 530 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 FAR2Q96K12 515 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 BIRC8Q96P09 236 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC7Q99615 494 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 MED18Q9BUE0 208 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GSX2Q9BZM3 304 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GALNT8Q9NY28 637 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 USF3Q68DE3 2245 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TRBC2A0A5B9 178 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CD8B2A6NJW9 211 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8KD6RF30 607 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GFYI3L273 518 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 AP3B1O00203 1094 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 DYRK3O43781 588 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TRAPPC6AO75865 159 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 VAPBO95292 243 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PAMP19021 973 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TNNI3P19429 210 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H2ADP20671 130 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 SAT1P21673 171 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R1BP30154 601 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 AHRP35869 848 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 GRIA1P42261 906 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 ATP5J2P56134 94 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 HSD17B7P56937 341 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CRADDP78560 199 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CCZ1BP86790 482 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 DUSP8Q13202 625 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 VEZF1Q14119 521 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 RCN2Q14257 317 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 TOMM20Q15388 145 aa5.66□□□□□ -1.5
CBX1-205ENST00000495350 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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