RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490437.5

SRI-210, Transcript of sorcin, human

TSL 2 BASIC

Gene SRI, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-210	ENST00000490437	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NEU3	Q9UQ49	428 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ATRX	P46100	2492 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NUP205	Q92621	2012 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MYH10	P35580	1976 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ANK1	P16157	1881 aa		2.54	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ACACA	Q13085	2346 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	C5orf60	A6NFR6	353 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SERINC4	A6NH21	518 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CLCA1	A8K7I4	914 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PRSS44	E7EML9	344 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RASGRF2	O14827	1237 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PSMD3	O43242	534 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZNF749	O43361	778 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SGTA	O43765	313 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTP4A3	O75365	173 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NDUFS3	O75489	264 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GOSR1	O95249	250 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CCNDBP1	O95273	360 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	EML2	O95834	649 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ITGA5	P08648	1049 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CCDC175	P0C221	793 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	FGF5	P12034	268 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TCF4	P15884	667 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RBL1	P28749	1068 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HMGCL	P35914	325 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NSG1	P42857	185 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	UQCRFS1	P47985	274 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SLC6A9	P48067	706 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RAB28	P51157	221 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ARSF	P54793	590 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HSD17B7	P56937	341 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TAS2R40	P59535	323 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CACNG1	Q06432	222 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	KIF5A	Q12840	1032 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TP53BP2	Q13625	1128 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ATP1A4	Q13733	1029 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	POU6F1	Q14863	301 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NAA25	Q14CX7	972 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NCF4	Q15080	339 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NOMO1	Q15155	1222 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SLC1A5	Q15758	541 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NDUFA9	Q16795	377 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	VWA2	Q5GFL6	755 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	BBS12	Q6ZW61	710 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PEX26	Q7Z412	305 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		2.53	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SNX20	Q7Z614	316 aa		2.53	□□□□□ -2

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