RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	TMEM206	Q9H813	350 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SKAP2-206	ENST00000489977	NEDD4	P46934	1319 aa		2.59	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PDHX	O00330	501 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CCS	O14618	274 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PRAF2	O60831	178 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	DIAPH2	O60879	1101 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CLN5	O75503	358 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SERPING1	P05155	500 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	STAG3L1	P0CL83	205 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	F3	P13726	295 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ATP6V1B1	P15313	513 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	MGMT	P16455	207 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PKLR	P30613	574 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SRPX	P78539	464 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ACY1	Q03154	408 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SLC34A1	Q06495	639 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	DUSP5	Q16690	384 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	MPP7	Q5T2T1	576 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	RPAIN	Q86UA6	219 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CARM1	Q86X55	608 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	MR1	Q95460	341 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	TAAR6	Q96RI8	345 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	APOL2	Q9BQE5	337 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PDF	Q9HBH1	243 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ITM2B	Q9Y287	266 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		2.58	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977		A8MVM7	634 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977		M0R296	226 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ZNF749	O43361	778 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SELENOF	O60613	162 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SAP30	O75446	220 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PTEN	P60484	403 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ASIC1	P78348	528 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	TSPY1	Q01534	308 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ITPK1	Q13572	414 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	LRRC38	Q5VT99	294 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	FAM219A	Q8IW50	185 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	RNF149	Q8NC42	400 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	TEKT1	Q969V4	418 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	NUS1	Q96E22	293 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	IDI2	Q9BXS1	227 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977		A0A087WZ39	114 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	FGF19	O95750	216 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	GH1	P01241	217 aa		2.56	□□□□□ -2
SKAP2-206	ENST00000489977	MT-ND1	P03886	318 aa		2.56	□□□□□ -2

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