RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 CA13Q8N1Q1 262 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ATL1Q8WXF7 558 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SLCO2A1Q92959 643 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM10Q96HG1 83 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9UFV3 132 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.76□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JMM0 328 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PPB8 328 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PRS3 328 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 NRDCO43847 1150 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ITGA10O75578 1167 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TTC4O95801 387 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINA6P08185 405 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SSR4P51571 173 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 CLCN2P51788 898 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-210ENST00000481231 MSS51Q4VC12 460 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SBSNQ6UWP8 590 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-210ENST00000481231 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-210ENST00000481231 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM156Q8N614 296 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 GPATCH11Q8N954 259 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TRPV3Q8NET8 790 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 NCLNQ969V3 563 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PELI2Q9HAT8 420 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 DEPPQ9NTK1 212 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-210ENST00000481231 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JN53 185 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PINLYPA6NC86 204 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 URADA6NGE7 173 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM166BA8MTA8 275 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 HAX1O00165 279 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGEF9O43307 516 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBB4AP04350 444 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 GLI4P10075 376 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TACR1P25103 407 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 ADH7P40394 386 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR143P51810 404 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 BTN3A2P78410 334 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 RUNX2Q13950 521 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 GALNT7Q86SF2 657 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 P3H2Q8IVL5 708 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 CERS2Q96G23 380 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 VMP1Q96GC9 406 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PBKQ96KB5 322 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-210ENST00000481231 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.74□□□□□ -1.01
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