RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 MEOX1P50221 254 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LIM2P55344 173 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MLF1P58340 268 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GPX6P59796 221 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IRF9Q00978 393 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GUCY2DQ02846 1103 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CAV1Q03135 178 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LAPTM5Q13571 262 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RCN2Q14257 317 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RNF175Q8N4F7 328 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TEX9Q8N6V9 391 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR2L5Q8NG80 312 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ELP5Q8TE02 316 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ASB15Q8WXK1 588 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 IFT81Q8WYA0 676 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NXNL1Q96CM4 212 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 VMP1Q96GC9 406 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SCYL1Q96KG9 808 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GPR137Q96N19 417 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SERINC2Q96SA4 455 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CSF3RQ99062 836 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GPR22Q99680 433 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SARGQ9BW04 601 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CD244Q9BZW8 370 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 AICDAQ9GZX7 198 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 VPS11Q9H270 941 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR51B5Q9H339 312 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RUBCNLQ9H714 662 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ACOT9Q9Y305 439 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 POLEQ07864 2286 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM166BA8MTA8 275 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 A8MVJ9 347 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf105B2RV13 164 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PRRG2O14669 202 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PEX1O43933 1283 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HS6ST1O60243 411 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NME2P1O60361 137 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR2J2O76002 312 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NEURL1O76050 574 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZFAND5O76080 213 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TPOP07202 933 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GSTA2P09210 222 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 COX6B1P14854 86 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 EPB42P16452 691 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NME2P22392 152 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CRABP2P29373 138 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TYK2P29597 1187 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PTGER1P34995 402 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CA7P43166 264 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PIK3CGP48736 1102 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HLCSP50747 726 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SSR4P51571 173 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SMSP52788 366 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HSD17B7P56937 341 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DLG1Q12959 904 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PFKFB4Q16877 469 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MED27Q6P2C8 311 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MTFR2Q6P444 385 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HSDL2Q6YN16 418 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CHSY3Q70JA7 882 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SULF2Q8IWU5 870 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GHDCQ8N2G8 530 aa7.53□□□□□ -1.2
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