RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 RHBGQ9H310 441 aa8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.46□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.46□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ADAM23O75077 832 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 INMTO95050 263 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 ITGAMP11215 1152 aa8.46□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 KRT33BQ14525 404 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 KCNC2Q96PR1 638 aa8.46□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 CSF3RQ99062 836 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PELI2Q9HAT8 420 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 CLEC1BQ9P126 229 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RHCGQ9UBD6 479 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RAB23Q9ULC3 237 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 GMEB1Q9Y692 573 aa8.46□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.45□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 C4orf51C9J302 202 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 H0Y8X5 98 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 JRKO75564 520 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 EML2O95834 649 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ANGPTL1O95841 491 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 EGFP01133 1207 aa8.45□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 RYKP34925 604 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 MAP2K4P45985 399 aa8.45□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 GPR153Q6NV75 609 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PARP8Q8N3A8 854 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.45□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 FEVQ99581 238 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 FGF22Q9HCT0 170 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 AHSPQ9NZD4 102 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.45□□□□□ -1.06
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CDHR3-211ENST00000478080 SEC14L2O76054 403 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 VIPP01282 170 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 POU2F1P14859 743 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 GSTM2P28161 218 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 BCL6P41182 706 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ENTPD1P49961 510 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 ADPRHP54922 357 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 SPIBQ01892 262 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 DUSP7Q16829 419 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.45□□□□□ -1.06
CDHR3-211ENST00000478080 FAHD1Q6P587 224 aa8.45□□□□□ -1.06
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