RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476783.5

PTBP2-208, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene PTBP2, Length 779 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTBP2-208	ENST00000476783	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ASB8	Q9H765	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	HACD3	Q9P035	362 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ABCA1	O95477	2261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CUBN	O60494	3623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A1W2PR48	441 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	HSPB2	A8KAH6	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	KCNK1	O00180	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FFAR3	O14843	346 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CASK	O14936	926 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	GPR42	O15529	346 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	KCNAB3	O43448	404 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FRS3	O43559	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PEX1	O43933	1283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	WDR1	O75083	606 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PHF2	O75151	1096 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LY86	O95711	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	AP2A1	O95782	977 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CYC1	P08574	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	KIT	P10721	976 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FPR1	P21462	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	IL1R2	P27930	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC7A1	P30825	629 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC26A3	P40879	764 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MC3R	P41968	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	STT3A	P46977	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	AGTR2	P50052	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ASCL1	P50553	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	HSPB2	Q16082	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LINC01560	Q8TB33	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ULK4	Q96C45	1275 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PERP	Q96FX8	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	COPS8	Q99627	209 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	NPAS2	Q99743	824 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MMP25	Q9NPA2	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783		A0A0J9YVX5	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	C2orf81	A6NN90	581 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	QSOX1	O00391	747 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FCHO1	O14526	889 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CTSV	O60911	334 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	STATH	P02808	62 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	CCDC172	P0C7W6	258 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	FAM157C	P0CG43	387 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	GABRA1	P14867	456 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	TPH1	P17752	444 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	BMP5	P22003	454 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTBP2-208	ENST00000476783	SLC6A9	P48067	706 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms