RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ALG12Q9BV10 488 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 POT1Q9NUX5 634 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO6Q9UM54 1294 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYM6O95789 1325 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NSD2O96028 1365 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SERINC4A6NH21 518 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FPGTO14772 594 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MLNRO43193 412 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SYNGR3O43761 229 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CTSVO60911 334 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNDC12O95881 172 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CELA2AP08217 269 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ACKR3P25106 362 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DLSTP36957 453 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH3B1P43353 468 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT6P51993 359 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GAS1P54826 345 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZXDAP98168 799 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF17Q02223 184 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GBE1Q04446 702 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DLG1Q12959 904 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF13Q15543 124 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RTL6Q6ICC9 239 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PIM3Q86V86 326 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GIPC3Q8TF64 312 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RLN3Q8WXF3 142 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 AZIN2Q96A70 460 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 VIPAS39Q9H9C1 493 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FKRPQ9H9S5 495 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SATB2Q9UPW6 733 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RIPK3Q9Y572 518 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1A2Q9Y585 309 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 A8MVM7 634 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CYR61O00622 381 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MATN3O15232 486 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT86O43790 486 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS2P07478 247 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PSG1P11464 419 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CA6P23280 308 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPN6P29350 595 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNJ4P48050 445 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DNA2P51530 1060 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NUCB2P80303 420 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT81Q14533 505 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SQLEQ14534 574 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIP10Q15642 601 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF626Q68DY1 528 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPAL3Q6P499 406 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CBLN3Q6UW01 205 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM131BQ86XD5 332 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35C1Q96A29 364 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SENP8Q96LD8 212 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB118Q96PH6 123 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB40CQ96S21 281 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CPVLQ9H3G5 476 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CALHM2Q9HA72 323 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LHX3Q9UBR4 397 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms