RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEPDC1Q5TB30 811 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR4C11Q6IEV9 310 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUZD1Q86UP6 607 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF354BQ96LW1 612 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDK15Q96Q40 435 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BLACEA4D250 179 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A8MUA0 341 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR7A17O14581 309 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHBGP04278 402 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HERVK_113P63132 956 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STX4Q12846 297 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNT11Q8NCW6 608 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTMT1Q9BV86 223 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSAG2Q9Y5P2 127 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ESPNB1AK53 854 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO1DO94832 1006 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFNA16P05015 189 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPN2P22792 545 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARFIP1P53367 373 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VSNL1P62760 191 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MEP1AQ16819 746 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACER2Q5QJU3 275 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FRG2Q64ET8 278 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLNKQ7Z7G1 428 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF175Q8N4F7 328 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HAS2Q92819 552 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FRG2BQ96QU4 278 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERPINI1Q99574 410 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF32Q9H0A6 362 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHF11Q9UIL8 331 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYR61O00622 381 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTNSO60931 367 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH16O75309 829 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GLRA3O75311 464 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUPT7LO94864 414 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCELO95171 688 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDPCPO95876 746 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 F10P00742 488 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSD17B3P37058 310 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCT5P48643 541 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNFSF10P50591 281 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEK2P51955 445 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAF3Q13114 568 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLAMF1Q13291 335 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUL3Q13618 768 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TERF2Q15554 542 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCRLBQ6BAA4 426 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP20A1Q6UW02 462 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TDRPQ86YL5 185 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSF3RQ99062 836 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR5H15A6NDH6 313 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLPP1O14494 284 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SBK3P0C264 359 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH13P55290 713 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERTAD2Q14140 314 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms