RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM47BQ8NA70 645 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TTLQ8NG68 377 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM237Q96Q45 408 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1F2PQ96R84 312 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 NTMT1Q9BV86 223 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 C5AR2Q9P296 337 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 DAPP1Q9UN19 280 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC189A1A4V9 331 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 URADA6NGE7 173 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 TTLL8A6PVC2 850 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YIV9 168 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRMT3O60678 531 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DPM1O60762 260 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LDB3O75112 727 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F21O95013 312 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 WDPCPO95876 746 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PROCP04070 461 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA7P05543 415 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CHN1P15882 459 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 BSGP35613 385 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR6P50406 440 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC18A2Q05940 514 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SLAMF1Q13291 335 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MFAP5Q13361 173 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD16Q32M84 506 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 TDRPQ86YL5 185 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 MTBPQ96DY7 904 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP4Q96P64 663 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LMF1Q96S06 567 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SERINC2Q96SA4 455 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HES7Q9BYE0 225 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTR8Q9H981 624 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB4Q9Y574 426 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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